Yang Huan's personal homepage

Education

2017-2020: Phd in Sun Yat-Sen University, Genetics, Tutor: Weizhong Li

2014-2017: MS in University of Electronic Science and Technology of China, Biophysics, Tutor: Hao Lin

2009-2014: BS in Harbin Medical University, Biotechnology

Work Experience

Yangtze Delta Region Institute(Quzhou) (2024.5-present): Associate Researcher

Guangdong Provincial People's Hospital Affiliated to Southern Medical University(2021.5-2024.4): Postdoctor Mentor: Huiying Liang

Personal Information

Fullname: Huan Yang

Birthday: 30 July 1990

Job: Associate Researcher

E-mail: huanyang0730@163.com

Address: Yangtze Delta Region Institute, Quzhou, Zhejiang, 324000

Research Interests: Medical Artificial Intelligence; Bioinformatics; Computational Bioinformatics

Funds

基于肿瘤微环境动态多模态解析的晚期非小细胞肺癌免疫治疗响应预测模型，国家自然科学基金青年基金，2025.1-2027.12，30万，在研，主持
非小细胞肺癌乏氧微环境多模影像量化及免疫治疗有效性预测研究，广东省医学科学技术研究基金，2023.7-2025.6，1万，在研，主持
基于视网膜影像和基因组学联邦迁移学习的先心病围术期不良事件预测及机制研究，国家自然科学基金面上项目，2023.1-2026.12，52万，在研，参与
巨噬细胞的极化异质性对卵巢癌腹水的分子调控机理，国家自然科学基金面上项目，2019.1-2022.12，55万，资助期满，参与

Publications

Yang H#, Yang M#, Chen J, Yao G, Zou Q, Jia L. Multimodal deep learning approaches for precision oncology: a comprehensive review. Briefings in Bioinformatics, 2024;26:bbae699. (SCI-2[Top], IF 2023=6.8)
Yang H#, Wu H#, Kong L#, et al., Precise Detection of Awareness in Disorders of Consciousness Using Deep Learning Framework. NeuroImage, 2024;290:120580. (SCI-2[Top], IF 2023=5.7)
Yang H#, Chen L#, Cheng Z#, et al., Deep learning-based six-type classifier for lung cancer and mimics from histopathological whole slide images: a retrospective study. BMC Medicine, 2021;19(1):80. (SCI-1[Top], IF 2020=8.775)
Yang H, Tang H, Chen X, et al., Identification of Secretory Proteins in Mycobacterium tuberculosis Using Pseudo Amino Acid Composition. BioMed Research International, 2016;2016:5413903. (SCI-3, IF 2015=2.134)
Chen Y#, Yang H#, Cheng Z, et al., A whole-slide image (WSI)-based immunohistochemical feature prediction system improves the subtyping of lung cancer. Lung Cancer, 2022;165:18-27. (SCI-2, IF 2021=6.081)
Zhang W, Zhang H, Yang H, et al., Computational resources associating diseases with genotypes, phenotypes and exposures. Briefings in Bioinformatics, 2019;20(6):2098-2115. (SCI-2[Top], IF 2018=9.1)
Liao Z, Yan C, Wang J, Zhang N, Yang H, et al., A clinical consensus-compliant deep learning approach to quantitatively evaluate human in vitro fertilization early embryonic development with optical microscope images. Artificial Intelligence in Medicine, 2024;149:102773. (SCI-2, IF 2023=7.5)
孔令聪，杨欢，胡联亭，等,. 基于眼心关联的先天性心脏病围手术期转归多实例预测。中国数字医学[J],2023:18(1):33-37. (中文核心期刊)
Zhang W#, Zeng B#, Yang M, Yang H, et al., A Manually Curated Database for Identification of Noncoding RNA Variants Associated with Human Diseases. Journal of Molecular Biology, 2021;433(11):166727. (SCI-2[Top], IF 2020=5.47)
Yao G#, Zhang W#, Yang M, Yang H, et al., MicroPhenoDB Associates Metagenomic Data with Pathogenic Microbes, Microbial Core Genes, and Human Disease Phenotypes. Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2020;18(6):760-772. (SCI-1[Top], IF 2019=7.051)
#Zhang T, #Tan P, #Wang L, #Jin N, Li Y, Zhang L, Yang H, et al., RNALocate: a resource for RNA Subcellular Localizations. Nucleic Acids Research, 2017;45(D1):D135-D138. (SCI-1[Top], IF 2016=10.162)
Liang Z, Lai H, Yang H, et al., Pro54DB: a database for experimentally verified sigma-54 promoters. Bioinformatics, 2017;33(3): 467-469. (SCI-2, IF 2016=7.307)

Patents

杨欢；孔令聪；骆文；梁会营；核磁共振图像分析方法、系统、装置及存储介质，2023-3-10，中国，202310235894.1。（受理）
杨欢；梁会营；全悟秀；李惠先；侯嘉鑫；一种免疫组化分子表达预测方法、装置、设备及存储介质，2025-1-21，中国，202510092837.1。（受理）
李伟忠；杨欢；柯尊富；陈丽丽；数字病理图像分析方法、系统、设备及存储介质，2024-2-29，中国, 202011279541.4。（授权）
姚国聪；杨欢；邹权；陈盛博；通过单细胞 Hi-C 生成不同分辨率插补结果的方法和系统，2024-9-29，中国，202411366869.8。（授权）
陈佳坭；杨欢；邹权；施华；基于腹部 CT 影像的胰腺自动分割方法和系统，2025-1-6，中国，202510017566.3。（受理）

Conference Presentations

杨欢；邹权；Deep Learning for Precision Medicine: Image-Based Applications in Complex Disease Diagnosis，第十三届全国生物信息学与系统生物学大会，海口，2024年10月9日-12日。（口头报告）
杨欢；DeepIHC: a whole slide image and immunohistochemitry based deep learning tool for accurate subtyping of lung adenocarcinoma，生物信息学与智能信息处理2019年学术会议（BIIP2019），南京, 2019年6月21日-23日。（口头报告）
杨欢；Automatic Image Assessment of Human Day 2-3 Embryos with BlasDet，第八届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨第一届（澳门）国际生物信息学研讨会，中国澳门，2018年10月22日-24日。（墙报报告）

Academic Service & Affiliations

浙江省生物信息学会学会青年委员会第二届委员
Medinformatics 常驻审稿人
BMC Medical Imaging 专业审稿人

Students (Alphabetical order)

陈佳坭，郭振豪，侯沛远，唐明灿，姚国聪

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Huan Yang （杨欢）