MSA
序列比对是将两个或多个序列排列在一起，标明其相似之处。序列中可以插入间隔（通常用短横线“-”表示）。对应的相同或相似的符号（在核酸中是A, T（或U）, C, G，在蛋白质中是氨基酸残基的单字母表示）排列在同一列上。这一方法常用于研究由共同祖先进化而来的序列，特别是如蛋白质序列或DNA序列等生物序列。在比对中，错配与突变相应，而空位与插入或缺失对应。序列比对还可用于语言进化或文本间相似性之类的研究。
比对基础
序列比对的基本问题、算法与评价方法。
重比对
按分割方式整理独立重比对工具和 MSA 工具中的迭代优化方法。
数据与评测
真实与模拟数据集，以及可复用的数据生成流程。
软件指南
课题组软件及第三方工具的安装、使用方法与实践经验。
开发工具
常用数据处理脚本、索引库和序列处理模块。
论文成果
按研究方向整理的课题组论文及相关软件。
多基因组数据资源
MGA-Dataset 持续整理多基因组比对与泛基因组研究的数据集说明、官方来源和下载入口。原始数据由各发布方提供，仓库提供分类导航与使用说明。